Mehdi Eker, 1956 senesinde Abdullah ve Fehime Eker çiftinin oğulları olarak Diyarbakır’ın Bismil ilçesinde dünyaya gelmiştir.
Diyarbakır Ziya Gökalp Lisesini bitirmiştir.
Ankara Üniversitesi Veterinerlik Fakültesinden mezun olmuştur.
Birleşik Krallık’ta yer alan Aberdeen Üniversitesi’nde Tarım Ekonomisi alanında master yapmıştır.
Ayrıca Ankara Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü’nde de doktorasını yapmıştır.
Hayvancılık Merkez Araştırma Enstitüsü’nde müdür yardımcılığı, İstanbul Büyükşehir Belediyesi Veteriner İşleri Müdürlüğü ve Tarım Bakanlığı Tarımsal Üretim ve Geliştirme Genel Müdür Yardımcılığı görevlerinde bulunmuştur.
Bunlara ek olarak Koruma ve Kontrol Genel Müdürlüğü ve Bakanlık Müşavirliği görevlerinde de bulunmuştur.
59, 60, 61 ve 62. Hükûmet’te Gıda, Tarım ve Hayvancılık Bakanı olarak görev yapmıştır.
TBMM 22, 23, 24, 26 ve 27. dönem AK Parti milletvekilidir.
7 Haziran 2015 tarihinde Milletvekilliği Genel Seçimleri’nde 3 dönem kuralı itibariyle aday olmamıştır.
Türkiye Cumhuriyeti tarihinin en uzun süre görev yapan tarım bakanı olarak bilinmektedir.
Mehdi Eker, İngilizce, Kürtçe ve Arapça dillerini bilmekte olup evli ve 3 çocuk sahibidir.
